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Visualisation graphique à distance

Pourquoi la visualisation à distance ?​

Les logiciels scientifiques génèrent souvent de grosses quantités de données, qu’il sera nécessaire de post-traiter, par exemple en utilisant des logiciels de visualisation.

Ces logiciels demandent des ressources non négligeables (carte graphique, mémoire) pas toujours disponibles dans les laboratoires. Il est par ailleurs laborieux de rapatrier systématiquement en local de gros fichiers de données.

La visualisation à distance permet de résoudre ces difficultés :

  • Les fichiers n’ont pas besoin d’être transférés
  • Les ressources graphiques nécessaires se trouvent à Calmip, il n’y a pas besoin de grosse station graphique au laboratoire pour visualiser les données, même en 3D, dans de bonnes conditions
caution

ATTENTION - VERSION DE TUBOVNC REQUISE >= 3.0.2 !

Prérequis​

Installation de Java​

Il suffit d'installer les paquets default-jre et son greffon pour les navigateurs internet: icedtea-plugin ou icedtea-netx (en fonction de la version de la distribution)

Si vous avez des soucis avec icedtea, merci d’installer la version d’Oracle sur votre système.

  • Aide détaillée d'installation : Installer java propriétaire depuis le site officiel
  • La version binaire (Linux x64) de java pour cette méthode est à télécharger depuis ici
  • Un résumé synthétique des commandes :
sudo apt-get install java-package
make-jpkg jre-8u231-linux-x64.tar.gz
sudo dpkg -i oracle-java8-jre_8u231_amd64.deb java -version

Installation de TurboVNC​

Le logiciel turboVnc version >= 3.0.2 doit être installé sur votre poste de travail, vous pouvez la télécharger ici

  • Installation
dpkg -i turbovnc_3.0.3_amd64.deb
  • Et en cas de dépendances manquante :
apt-get -f install
  • Exécution
/opt/TurboVNC/bin/vncviewer

Comment se connecter ? (en 3 petites étapes)​

Étape 1 :​

Connectez-vous sur Turpan par ssh voir ici pour avoir plus de détails. Par exemple :

ssh username@turpanlogin

Étape 2 :​

Dans un terminal sur turpan executer la commande suivante pour démarrer une session de visualisation :

runVisuSession.sh

Il s’agit d’une session interactive, qui ne doit pas être interrompue : si vous l’interrompez (par CTRL-C par exemple ou en fermant la fenêtre), la connexion graphique s’interrompt.

Exemple de bannière :

[  2/150] Queuing and waiting for Visu session resources initialization (18697) ...

Remote desktop ...

#===========================================================================
|
| Point TurboVnc viewer on your computer to : 10.42.22.11:5901
|            Full control one-time password : 27479540
|
+---------------------------------------------------------------------------
| From a shell on a login node, to get a new full control one-time password,
| use :
|    ssh turpanvisu0 '/opt/TurboVNC/bin/vncpasswd -o -display :1'
|
#===========================================================================
| CAUTION : DO NOT CLOSE this slurm job or this terminal !
#===========================================================================

+---------------------------------------------------------------------------
| CONNECTION INFO : 
|   * Job ID  : 18697
|   * Client  : 172.17.136.10 (THROUGH THE ECA ADMIN VPN)
|   * Target  : 10.42.22.11 (turpanvisu0)
|   * Display : 5901 (1 on turpanvisu0)
+---------------------------------------------------------------------------
| TurboVnc 3.0.2 or later is needed on your computer to access visu session
| See https://sourceforge.net/projects/turbovnc/files/
+---------------------------------------------------------------------------

[/] - Press CTRL-C to quit

Étape 3 :​

Sur votre poste, lancez l’exécutable suivant de turboVNC :

vncviewer
  • Entrez dans le champ VNC Server l’adresse donnée par le script ci-dessus : turpanlogin.calmip.univ-toulouse.fr:5902 (dans notre exemple)

Capture d'écran du formulaire d'engistrement dans le SSO MesoNET

  • Entrez dans le champ Password le jeton d'authentification donné par le script ci-dessus : 91668926 (dans notre exemple)

Capture d'écran du formulaire d'engistrement dans le SSO MesoNET

  • Le gestionnaire de fenêtre utilisé est gnome-classic. Cliquer sur "Applications" pour faire appaître le menu des applications.
caution

Si vous avez un écran noire avec l'heure, pressez la touche "entrée" de votre clavier

  • Si vous fermez la fenêtre du vncviewer, vous devrez générer de nouveau un jeton d'authentification avec la commande donnée par le script ci-dessus (dans notre exemple) : 
ssh turpanvisu0 '/opt/TurboVNC/bin/vncpasswd -o -display :2'
caution

Toutes les communications entre votre poste de travail et le nœud graphique sont chiffrées

  • Pour avoir accès aux caractères de contrôle, passer en plein écran, etc. pressez sur la touche F8 pour afficher le menu VNC (Ctrl-Alt-MAJ F pour quitter le plein écran)

Autres informations utiles​

Comment arrêter une session de visualisation​

Vous pouvez arrêter la session de visualisation de 2 façons :

  • Soit en allant sur le terminal dans lequel vous avez lancé runVisuSession.sh, et tapez :
    CTRL-C
  • Soit allant dans le menu de démarrage menu de démarrage, puis en cliquant sur son identifiant et enfin sur le menu "Log Out"

logout.

Quelques raccourcis clavier:​

Par défaut les touches de contrôle ne sont pas utilisables car elles sont interceptées par votre poste de travail. Mais cela peut être modifié (à condition d’utiliser 4 doigts !) par :

CTRL-SHIFT-ALT G

Attention dans ce cas la session graphique a tout le contrôle de votre clavier, du coup c’est votre poste de travail qui ne répondra pas à votre clavier ni dans certains cas à la souris (on a l’impression qu’il est planté, mais ce n’est pas vrai). Dans ce cas, pressez à nouveau sur CTRL-SHIFT-ALT G pour retrouver le fonctionnement normal.

Si vous travaillez longtemps sur la visualisation, vous aimerez probablement passer en plein écran :

CTRL-SHIFT-ALT F

Plus de résolution, plus de mémoire, plus de processeurs:​

Pour la quantité de mémoire allouée (5000Mo par défaut) ou le nombre de cœurs utilisés (1 cœur par défaut), vous pouvez utiliser les options suivantes avec la commande runVisuSession.sh :

  • --mem XM (max 50000M)
  • --cpus-per-task Z (max 8 cœurs)
  • -h Affiche l’aide

En cas d’accès réseau difficiles:​

Si vous travaillez sur un site distant, ou via une liaison de mauvaise qualité, vous aurez peut-être de mauvaises performances graphiques, au moins en 3D.

Vous avez alors la possibilité de dégrader la qualité de l’image afin d’améliorer son interactivité :

  • Cliquez sur le bouton en haut à gauche de la fenêtre TurboVnc

Capture d'écran du formulaire d'engistrement dans le SSO MesoNET

  • Une fenêtre s’ouvre, vous donnant accès à deux outils permettant de jouer sur la compression jpeg : le premier diminue ou supprime les couleurs, le second joue sur la résolution

Capture d'écran du formulaire d'engistrement dans le SSO MesoNET

Partager sa session graphique​

Il est possible de partager la session graphique :

Pour cela depuis votre session graphique, exécutez la commande suivante qui va générer 2 jetons :

/opt/TurboVNC/bin/vncpasswd -o -display :1 -v
  • en lecture seule (View-only): vous travaillez et vos correspondants peuvent suivre ce que vous faites, mais ils ne peuvent pas intervenir
  • en lecture-écriture (Full control): travail à plusieurs sur la même session. Attention, vous donnez ainsi à votre correspondant accès à tout votre compte sur Turpan !

Vous pouvez partager la session plusieurs fois, autant de fois que de partages simultanés souhaités. Pour chaque correspondant vous devrez générer un nouveau mot de passe.

Enfin, il faut donner a votre correspondant les informations de connexions à votre session ainsi que le jeton ci-dessus :

[  1/150] Queuing and waiting for visu session resources allocation (6043) ...
[...]
| Point TurboVnc viewer on your computer to : turpanlogin.calmip.univ-toulouse.fr:5902
[...]

En cas d'erreur :​

Merci de décrire précisément votre problème et de mettre l'intégralité de la bannière de connexion afin que le support dispose de l'ensemble des informations nécessaires pour la résolution du problème. S'il s'agit d'un problème de filtrage, merci de vérifier que les flux suivant sont autorisés en sortie de votre réseau :

  • Depuis votre réseau vers turpanlogin1.calmip.univ-toulouse.fr (194.57.114.216) sur le port 22 (ssh) et les ports 5901 à 5932 (VNC)
  • Depuis votre réseau vers turpanlogin2.calmip.univ-toulouse.fr (194.57.114.217) sur le port 22 (ssh) et les ports 5901 à 5932 (VNC)

Comment ça marche ?​

Tout cela fonctionne grâce à :

  • Un nœud graphique de 220 Gb de mémoire et 14 cœurs et 1 carte NVIDIA A40 (2 noeuds au total sont disponibles)
  • Le logiciel virtualGL

Capture d'écran du formulaire d'enregistrement dans le SSO MesoNET